Le lin est à prendre à distance des autres médicaments. Il faut compter un intervalle de 30 à 60 minutes entre les deux traitements. Attention à ne pas l’utiliser avant le coucher. Son délai d’action est de 24-48h donc soyez patient. De plus, il peut engendrer des météorismes. Il est contre indiqué dans le cas d'un syndrome occlusif ou sub-occlusif, de syndromes douloureux abdominaux de cause indéterminée ou de fécalomes. Des interactions médicamenteuses sont suspectées en cas de prise d'anticoagulants ou d’anti-agrégant plaquettaires. En effet, le lin peut augmenter le temps de saignement. De plus, les lignanes présents dans la graine de lin ont des propriétés œstrogéniques. Il n’est donc pas recommandé en cas de grossesse, d' allaitement, d' antécédents de cancer hormone-dépendant ou chez l'enfant. Enfin, le patient diabétique (insulino- ou non insulino-dépendant) doit être sous surveillance lorsqu'il prend du lin car il freine l’absorption des sucres, ce qui diminue l’hyperglycémie post-prandiale et cela peut déséquilibrer son diabète. Il faut être prudent chez la personne alitée ou en cas de mégacôlon. Il faut s’assurer que la personne âgée à une hydratation suffisante.